用暗蛋白照亮肿瘤细胞

哥伦比亚大学的研究人员揭示了基因组的“暗”部分如何让免疫系统检测到癌细胞，这可能会导致更好的免疫疗法。

免疫系统通过细胞的肿瘤特异性抗原识别癌细胞，这些抗原是在癌细胞表面独特发现的降解蛋白质片段。先前的研究表明，绝大多数肿瘤特异性抗原是由非编码基因组产生的，科学家们认为直到最近，基因组的“黑暗”部分才编码任何蛋白质。

肿瘤细胞如何显示这些“暗”蛋白的片段是一个悬而未决的问题，哥伦比亚大学 Vagelos 医学院医学和系统生物学助理教授 Xuebing Wu 博士本周在《自然》杂志上发表的一项新研究回答了这个问题和外科医生，以及他的团队。

“许多以前的研究都试图描述这个过程，但每一个都只关注一个或几个 DNA 序列，”Wu 说。“他们取得了非常重要的发现，但彼此之间几乎没有达成一致。目前尚不清楚他们发现的机制是否广泛适用于基因组中所有类型的非编码序列。”

为了寻求更全面的答案，Wu 和他的团队在两名研究生 Jordan Kesner 和 Ziheng Chen 的带领下使用了大规模并行分析，涉及大约 10,000 个人类非编码基因序列和数百万个合成随机序列。“我们发现的是一种适用于所有类型非编码序列的统一机制，”吴说。

这导致他们发现了一种非编码序列特有的信号，该信号会触发那些无功能蛋白质的降解，这是制造抗原的第一步。然后，研究人员使用 CRISPR 技术敲除每个人类基因，揭示了识别该信号的分子机制——BAG6 复合体。

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